王恩茂在生命的最后几年中，双目失明，身体虚弱，需要到内地去治疗，但他坚持每年回新疆住几个月，一定要和新疆的各族干部群众生活在一起。2001年4月12日，王恩茂因病医治无效在北京逝世，遵其生前遗愿，将他的骨灰安葬在新疆乌鲁木齐。
（6）特殊财富留后人
王恩茂戎马一生，在革命战争年代，无论环境多么艰难，战斗多么激烈，工作多么繁忙，始终保持着写日记的良好习惯。在我军历史上，许多革命将帅都在一定时期写过日记，并对撰写军史、战史起到过帮助作用，但是，像王恩茂这样长期不间断地、一天接一天地把一个方面军从长征到建国初期的历史进程和所有重大事件完整、详细地记述下来，实在是不多，能够在如此漫长而艰苦的革命岁月里记下那么多的日记，真是个奇迹。这些珍贵的史料，对于后人了解那段历史具有至关重要的作用。
从1934年10月23日开始，一直到1949年11月30日，在长达15年的时间里，王恩茂记下了18本日记。日记共分为5个部分，即红6军团长征到“七七”事变前夕，359旅北上华北抗日前线时期，359旅到陕北保卫陕甘宁边区参加南泥湾大生产时期，以359旅为主力的八路军南下支队从延安南下到广东、又从广东北返到延安时期，第1野战军第2纵队、第1兵团第2军在解放战争时期。在日记里，他如实记录了自己所经历的革命岁月与战争风云，也详细记录了他屡次聆听毛主席重要指示的过程及内容等。
